1CD Linux Backtrack 2.0を1GBのUSBメモリスティックにインストールしてUSBメモリからBootできました。  

Backtrackのサイト http://backtrack.offensive-security.com/ のHow-toの中にWindowsで動作するツールを使った簡単なインスト-ル方法が紹介されてます。

BackTrack 2.0 final , automated download and installation on USB Stick from windows
http://backtrack.offensive-security.com/index.php?title=Howto:_BackTrack_2.0_final_%2C_automated_download_and_installation_on_USB_Stick_from_windows

というタイトルです。 「BackTrack 2 USB 4 WIN」の使用方法の説明があります。

BT2USB4WINBETARELIZ2.rarの入手先URLも記載があります。

BT2USB4WINBETARELIZ2.rarをWinrarで解凍すると、BT2USB4WIN.exeが出現します。

http://www.remote-exploit.org/backtrack_download.html から約700MBのbt2final.isoをダウンロードしておきます。

BT2USB4WIN.exeを実行します。

「ENGLISH」ボタンを押します。

Please, choose the type of installation you want to realize :
1. Please Download the latest BackTrack Suite, and Install it to my USB-stick.
2. I've already got a BackTrack release, check it and install to my USB-Stick.

すでにbt2final.isoを入手してあるので、2番を選びます。

後は画面の指示に従って進めていきます。

Please select your USB-Stick Root: でUSBメモリを指定します。

USBメモリはフォーマットされますので、注意してください。

Select your releaseでbt2final.isoを選択します。

バッチファイルが動作して、USBメモリへのコピーが始まります。

いくつかのメッセージウインドウが表示されますが、「はい」を選択します。

終了すると次の画面が表示されます。

これでUSBメモリスティックへのインストールが終了です。

必要な場合はパソコンのBIOSセットアップ画面でBoot orderをUSBメモリからBootする様変更します。

ちゃんとUSBメモリスティックからブートしてBT2が起動しました。